房屋超面积确实可能影响产权证的办理。

从法律角度分析，房屋的建造应符合城市规划，未经审批擅自超建的部分属于非法建筑，房管局作为房地产主管部门，对非法建筑没有发放房产证的依据。因此，超出的面积部分无法获得产权证。当发现房屋超面积且无法办理产权证时，若收到相关部门的整改通知或处罚决定，则表明问题已比较严重，应及时寻求专业律师的帮助。
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从法律角度来看，房屋超面积不能办产权证的问题，常见的处理方式有以下几种：一是主动向审批机关报告，并补交相关费用；二是与开发商或卖方协商，解决面积差异问题；三是若协商无果，可考虑通过法律途径解决。

在选择处理方式时，应优先考虑与审批机关沟通并补交费用，若此方法不可行，再尝试与开发商或卖方协商。若协商过程中遇到阻碍或对方不配合，可考虑通过法律途径维护自身权益。
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从法律的角度，房屋超面积不能办产权证的问题在不同情况下，处理方式具体如下：

1. 若房屋超出审批面积，建房者应主动向审批机关报告，并补交一定费用。隐瞒事实被查证后，可能被视为违章建筑并限期拆除。
2. 办理房产证时发现面积超过预期或合同约定，应核查合同条款，确认是否存在关于面积差异的条款。若合同中有明确规定，则按照合同条款执行。
3. 若合同中没有明确规定或面积超过合同约定的范围，应与开发商协商，要求其对超出面积的部分进行退款，或协商一个双方都能接受的补偿方案。若协商无果，可考虑通过法律途径解决问题，如提起诉讼。在提起诉讼前，应收集好相关证据，如购房合同、房产证、测绘报告等。

在处理此类问题时，应保持冷静和理性，尽量通过和平方式解决问题，并寻求专业律师的帮助以确保自身权益得到最大保障。